En 1969, el Museo Escolar de Puçol surgió como parte del Proyecto Pedagógico “La Escuela y su Medio”, con el objetivo de integrar el aprendizaje de oficios, tradiciones y el medio natural del Campo de Elche en el currículum educativo. Este esfuerzo buscaba conservar una cultura en declive debido a la mecanización agrícola y el cambio en los métodos de cultivo. En sus inicios, el museo, ubicado en las antiguas viviendas de los maestros de la escuela, no solo se centraba en recuperar y exponer objetos, sino que fomentaba la participación activa de la comunidad para preservar la cultura local.

Inicialmente, el proyecto abarcaba solo la partida rural de Puçol, pero pronto ganó notoriedad a través de la prensa local, lo que permitió su expansión a otras áreas rurales de Elche. El aumento en las donaciones llevó al establecimiento del Museo Escolar Agrícola.

Durante los años noventa, el alcance del proyecto se extendió a la ciudad de Elche, lo que incrementó significativamente las donaciones. En 1992, se creó una asociación sin ánimo de lucro para gestionar el museo de manera sostenible. La Consellería de Cultura, Educación y Ciencia reconoció el museo oficialmente en junio de 1992, y en 1993, el Ayuntamiento financió la primera ampliación arquitectónica del centro. En 1998, se adquirió una parcela adicional de 8.000 m², permitiendo una segunda ampliación que culminó en 2001 con la inauguración del nuevo complejo museístico. El Centro de Cultura Tradicional Museo Escolar de Puçol, como se le conoce ahora, cuenta con amplias instalaciones, incluyendo salas de exposiciones, talleres de conservación, biblioteca, y un huerto de estudios medioambientales.

El reconocimiento al proyecto alcanzó su punto culminante en 2009 cuando la UNESCO inscribió el Centro de Cultura Tradicional Museo Escolar de Puçol en el Registro de Buenas Prácticas de Salvaguardia del Patrimonio Cultural Inmaterial, convirtiéndolo en el tercer Patrimonio de la Humanidad de Elche. Además, recibió la Mención Especial de Educación, Formación y Sensibilización del Patrimonio Cultural en los premios Europa Nostra y la Medalla del Mérito Cultural de la Generalitat Valenciana. En 2011, el Ayuntamiento de Elche le concedió la Medalla del Bimil.lenari por su destacada trayectoria, y en 2014 recibió el I Premio Iberoamericano de Educación y Museos de Ibermuseos. El reconocimiento más reciente fue otorgado en 2016 por el Sistema Integral de Calidad Turística en Destino (SICTED) del Ministerio de Turismo.

Actualmente, el museo ha formado a casi 500 escolares, cuenta con más de 1.750 donantes y posee una colección de más de 100.000 ítems relacionados con la etnología, la agricultura, el comercio, la industria, el folklore y las tradiciones de Elche y su entorno.

A finales de 2016, el Museo Escolar de Puçol enfrentó dificultades económicas que llevaron a una crisis y a la paralización de sus actividades. Para superar esta situación, se constituyó en febrero de 2022 la Fundación de la Comunitat Valenciana Proyecto Puçol para la Educación y la Cultura. Esta nueva fundación, compuesta por quince miembros del Ayuntamiento de Elche y de la asociación, tiene como objetivo asegurar la seguridad jurídica y la solidez financiera del museo, promoviendo la salvaguarda de la cultura y tradiciones de Elche y apoyando el proyecto educativo y museístico.